6月6日，苍南县近海海域发生赤潮。我所获悉赤潮消息后，迅速响应，联合温州市农业农村局、苍南县农业农村局制定了赤潮应急监测方案，并组成了专家团队对温州近海海域开展了高频次、连续性的应急监测，通过精准的数据采集与分析，提供了技术研判和专业结论，为苍南县海区水产品质量安全应急监测和风险防控提供了技术支撑。

6月6日苍南县近海海域赤潮发生后，苍南县农业农村局发布紧急通知，从2025年6月7日14时起禁止采捕苍南县内海域养殖海洋贝类水产品上市。6月7日至9日，我所检测中心现场调研了苍南县四个赤潮爆发现场，察看了40余个海区站点情况，合计采集生物体样品16批次和海水样品26批次，对麻痹性贝类毒素和腹泻性贝类毒素进行了监测，并利用镜检连续对重要站点海水中的浮游植物进行了鉴定，得出了塔玛亚历山大藻正在步入快速消亡阶段的结论。6月10至11日，我所检测中心在持续开展得苍南县水产品贝类毒素监测中，均为未检出相关毒素。6月11日下午15点，苍南县农业农村局根据相关监测结果，发布了“关于解除苍南海域贝类水产品禁捕禁售令的通知”。